学校在继续教育方面具有丰富的资源，拥有卫生部全科医学培训中心、北京市全科医学培训中心、中医类别全科医师培训基地、首都卫生管理与政策研究基地、北京地区实验动物屏障设施运行与管理培训基地等。多年来学校主动适应社会需求,与卫生部、北京市卫生局、北京市中医管理局合作，开展全科医师培训、社区卫生管理人员培训、社区护理学师资培训、住院医师规范化培训（必修课程）、卫生管理干部培训、中医药实用人才培养等；受教育部委托，举办高等学校青年骨干教师高级研修班，对来自全国各高等医学院校的青年骨干教师进行临床技能教学培训；与相关协会合作，开展动物实验技术人员和管理人员培训等。充分发挥了学校在继续教育方面的社会服务职能，为推动学习型社会建设做出积极贡献。